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Posted on 2014-08-21 15:07 TWaver 阅读(624) 评论(0) 编辑 收藏
生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年，著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章完全给我们描述了人类基因组测序未来的蓝图，可见3D技术在很多领域都是发展方向。
使用mono可以快速的创建DNA分子结构立体模型，效果如下：
当然简单的呈现DNA分子结构，仅仅是一部分功能，如果将mono和专业的DNA分析仪结合，不仅可以发现病症，更重要的是预测病症的发生，治病于未发，这将是人类的福音。除了研究人类基因之外，我们还可以对农作物的进行DNA3D模型化，并加以分析，对农业的发展和粮食安全方面都会有积极的意义。
使用mono创建3D模型最大的特点就是快，代码不过几十行，使用Editor更是不需要代码量。本文的效果图通过代码实现，核心代码如下： 1 | function createDNA(box, x, y, z, colors){ |
2 | var count=20+Math.random()*50; |
4 | var parent=createNode(box, 10, 0,0,0,'red'); |
5 | for(var i=0;i<count;i++){ |
6 | var angle=Math.PI*2/360*15*i; |
7 | var radius = (i % 2==0) ? 10 : 7; |
8 | var color = colors[i%2] |
9 | var node1=createPairNode(box, dist, radius, i, angle, color); |
10 | var node2=createPairNode(box, dist*0.3, radius, i, angle, color); |
11 | node1.setParent(parent); |
12 | node2.setParent(parent); |
15 | var link=createLink(box, node1, node2, dist, angle, 'gray'); |
16 | var node3=createPairNode(box, dist*0.58, radius*0.4, i, angle,'cyan'); |
17 | var node4=createPairNode(box, dist*0.72, radius*0.4, i, angle,'cyan'); |
18 | link.setParent(parent); |
19 | node3.setParent(parent); |
20 | node4.setParent(parent); |
23 | parent.setPosition(x,y,z); |
24 | parent.setStyle('m.visible',false); |
1 | function createPairNode(box, size, radius, index, angle, color){ |
2 | var x=size*Math.sin(angle); |
3 | var z=size*Math.cos(angle); |
5 | var node = createNode(box, radius, x, y, z, color); |
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