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Posted on 2014-08-21 15:07 TWaver 阅读(626) 评论(0) 编辑 收藏
生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年,著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章完全给我们描述了人类基因组测序未来的蓝图,可见3D技术在很多领域都是发展方向。 使用mono可以快速的创建DNA分子结构立体模型,效果如下:
当然简单的呈现DNA分子结构,仅仅是一部分功能,如果将mono和专业的DNA分析仪结合,不仅可以发现病症,更重要的是预测病症的发生,治病于未发,这将是人类的福音。除了研究人类基因之外,我们还可以对农作物的进行DNA3D模型化,并加以分析,对农业的发展和粮食安全方面都会有积极的意义。 使用mono创建3D模型最大的特点就是快,代码不过几十行,使用Editor更是不需要代码量。本文的效果图通过代码实现,核心代码如下: 1 | function createDNA(box, x, y, z, colors){ |
2 | var count= 20 +Math.random()* 50 ; |
4 | var parent=createNode(box, 10 , 0 , 0 , 0 , 'red' ); |
5 | for (var i= 0 ;i<count;i++){ |
6 | var angle=Math.PI* 2 / 360 * 15 *i; |
7 | var radius = (i % 2 == 0 ) ? 10 : 7 ; |
8 | var color = colors[i% 2 ] |
9 | var node1=createPairNode(box, dist, radius, i, angle, color); |
10 | var node2=createPairNode(box, dist* 0.3 , radius, i, angle, color); |
11 | node1.setParent(parent); |
12 | node2.setParent(parent); |
15 | var link=createLink(box, node1, node2, dist, angle, 'gray' ); |
16 | var node3=createPairNode(box, dist* 0.58 , radius* 0.4 , i, angle, 'cyan' ); |
17 | var node4=createPairNode(box, dist* 0.72 , radius* 0.4 , i, angle, 'cyan' ); |
18 | link.setParent(parent); |
19 | node3.setParent(parent); |
20 | node4.setParent(parent); |
23 | parent.setPosition(x,y,z); |
24 | parent.setStyle( 'm.visible' , false ); |
1 | function createPairNode(box, size, radius, index, angle, color){ |
2 | var x=size*Math.sin(angle); |
3 | var z=size*Math.cos(angle); |
5 | var node = createNode(box, radius, x, y, z, color); |
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