用svg格式输出没有问题。
网上解释，据说有两个问题要解决：
- dot文件需要为utf8编码
- 需要指定fontname
对于我来讲，第一点不成问题，我缺省编码就是utf8
那么关键就是第二个问题了
centos5.x下
yum install fonts-chinese
centos6.x下
yum install cjkuni-ukai-fonts
然后在.dot文件中指出：
node [ fontname = "AR PL ZenKai Uni" ];
(centos6.x用
node [ fontname = "AR PL UKai CN" ];
其实经我测试，只要包安装完毕，fontname不用改成能中文显示正常。