选择Hibernate还是iBATIS都有它的道理：
Hibernate功能强大，数据库无关性好，O/R映射能力强，如果你对Hibernate相当精通，而且对Hibernate进行了适当的封装，那么你的项目整个持久层代码会相当简单，需要写的代码很少，开发速度很快，非常爽。
Hibernate的缺点就是学习门槛不低，要精通门槛更高，而且怎么设计O/R映射，在性能和对象模型之间如何权衡取得平衡，以及怎样用好Hibernate方面需要你的经验和能力都很强才行。
iBATIS入门简单，即学即用，提供了数据库查询的自动对象绑定功能，而且延续了很好的SQL使用经验，对于没有那么高的对象模型要求的项目来说，相当完美。
iBATIS的缺点就是框架还是比较简陋，功能尚有缺失，虽然简化了数据绑定代码，但是整个底层数据库查询实际还是要自己写的，工作量也比较大，而且不太容易适应快速数据库修改。
我的建议就是：
如果你的团队没有Hibernate高手，那么请用iBATIS，要把Hibernate用好，并不容易；否则你应该选择Hibernate，那样你的开发速度和代码简洁性都相当棒！
BTW：
我觉得rails的ActiveRecord是平衡性做的最好的，避免了Hibernate的复杂性和学习HQL的成本，同时具备iBATIS即学即用的简单性。
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简介
Hibernate 是当前最流行的O/R mapping框架，当前版本是3.05。它出身于sf.net，现在已经成为Jboss的一部分了
iBATIS 是另外一种优秀的O/R mapping框架，当前版本是2.0。目前属于apache的一个子项目了。
相对Hibernate“O/R”而言，iBATIS 是一种“Sql Mapping”的ORM实现。
Hibernate对数据库结构提供了较为完整的封装，Hibernate的O/R Mapping实现了POJO 和数据库表之间的映射，以及SQL 的自动生成和执行。程序员往往只需定义好了POJO 到数据库表的映射关系，即可通过Hibernate 提供的方法完成持久层操作。程序员甚至不需要对SQL 的熟练掌握， Hibernate/OJB 会根据制定的存储逻辑，自动生成对应的SQL 并调用JDBC 接口加以执行。
而iBATIS 的着力点，则在于POJO 与SQL之间的映射关系。也就是说，iBATIS并不会为程序员在运行期自动生成SQL 执行。具体的SQL 需要程序员编写，然后通过映射配置文件，将SQL所需的参数，以及返回的结果字段映射到指定POJO。
使用iBATIS 提供的ORM机制，对业务逻辑实现人员而言，面对的是纯粹的Java对象，
这一层与通过Hibernate 实现ORM 而言基本一致，而对于具体的数据操作，Hibernate会自动生成SQL 语句，而iBATIS 则要求开发者编写具体的SQL 语句。相对Hibernate而言，iBATIS 以SQL开发的工作量和数据库移植性上的让步，为系统设计提供了更大的自由空间。
二者的对比：
1． iBATIS非常简单易学，Hibernate相对较复杂，门槛较高。
2． 二者都是比较优秀的开源产品
3． 当系统属于二次开发,无法对数据库结构做到控制和修改,那iBATIS的灵活性将比Hibernate更适合
4． 系统数据处理量巨大，性能要求极为苛刻，这往往意味着我们必须通过经过高度优化的SQL语句（或存储过程）才能达到系统性能设计指标。在这种情况下iBATIS会有更好的可控性和表现。
5． iBATIS需要手写sql语句，也可以生成一部分，Hibernate则基本上可以自动生成，偶尔会写一些Hql。同样的需求,iBATIS的工作量比Hibernate要大很多。类似的，如果涉及到数据库字段的修改，Hibernate修改的地方很少，而iBATIS要把那些sql mapping的地方一一修改。
6． 以数据库字段一一对应映射得到的PO和Hibernte这种对象化映射得到的PO是截然不同的，本质区别在于这种PO是扁平化的，不像Hibernate映射的PO是可以表达立体的对象继承，聚合等等关系的，这将会直接影响到你的整个软件系统的设计思路。
7． Hibernate现在已经是主流O/R Mapping框架，从文档的丰富性，产品的完善性，版本的开发速度都要强于iBATIS
8． 最关键的一句话是iBATIS的作者说的：
If you are starting a new project and you're in full control of your object model and database design, Hibernate is a good choice of O/R tool.
If you are accessing any 3rd party databases (e.g. vendor supplied), or you're working with a legacy database, or even just a really poorly designed database, then an O/R mapper might not be capable of handling the situation. That's were an SQL Mapper comes in handy
结论:
结论:
Hibernate 和iBATIS可以说是互相补充,共同发展的关系.具体你想用什么要看实际情况.如果看了上面的文字还是拿不定注意,那就Just to try it.实践是检验真理的唯一标准.鞋合不合适,只有试了才知道