InnoDB 是 MySQL 上第一个提供外键约束的引擎，除了提供事务处理外，InnoDB 还支持行锁，提供和 Oracle 一样的一致性的不加锁读取，能增加并发读的用户数量并提高性能，不会增加锁的数量。
InnoDB 的设计目标是处理大容量数据时最大化性能，它的 CPU 利用率是其他所有基于磁盘的关系数据库引擎中最有效率的。
InnoDB 是一套放在 MySQL 后台的完整数据库系统，InnoDB 有它自己的缓冲池，能缓冲数据和索引，InnoDB 还把数据和索引存放在表空间里面，可能包含好几个文件，这和 MyISAM 表完全不同，在 MyISAM 中，表被存放在单独的文件中，InnoDB 表的大小只受限于操作系统文件的大小，一般为 2GB。
MySQL 的源代码中，从 3.23.34a 开始包含 InnoDB 表，并在 MySQL -Max 的二进制版本中激活。
如果你使用源码版本下载，自己编译的话，需要采用 --with-innodb 选项：
./configure --with-innodb
在 MySQL-Max-3.23 上使用 InnoDB 时，必须在 my.cnf 或者 my.ini 文件中的 [mysqld] 小节指定启动参数：
innodb_data_file_path=ibdata:30M
InnoDB 以 GNU GPL 版本 2 的许可发布。
MySQL-Max-3.23: 这个产品可以用于生产环境使用。
MySQL-4.0: 这个是开发版本，和 3.23 相比增加了多表删除，查询结果缓冲，SSL 通信，4.0.1 为 Beta 版本。
在 3.23 中，必须至少指定 innodb_data_file_path 的大小，但是在 MySQL-4.0 中这个值默认为 64MB，文件名为 ibdata1。
为了得到好的性能，必须指定 InnoDB 参数，例如：
对于一台 128MB 内存， 10GB 硬盘的 Windows NT 机器的配置如下：
[mysqld]
innodb_data_home_dir = c:\ibdata
# 数据文件必须能容下数据和索引
innodb_data_file_path = ibdata1:2000M;ibdata2:2000M
# 设置缓冲池大小为内存的 50 - 80 %
set-variable = innodb_buffer_pool_size=70M
set-variable = innodb_additional_mem_pool_size=10M
innodb_log_group_home_dir = c:\iblogs
# log_arch_dir 必须和 log_group_home_dir 一样
innodb_log_arch_dir = c:\iblogs
innodb_log_archive=0
set-variable = innodb_log_files_in_group=3
# 设置日志文件大小为缓冲池的 15%。
set-variable = innodb_log_file_size=10M
set-variable = innodb_log_buffer_size=8M
# 如果丢失最近的几个事务影响不大的话，设置 flush_log_at_trx_commit 为 0。
innodb_flush_log_at_trx_commit=1
set-variable = innodb_file_io_threads=4
set-variable = innodb_lock_wait_timeout=50
注意 InnoDB 不会自己建立目录，你必须使用操作系统命令建立目录，并注意 MySQL 的权限。
第一次运行 MySQL 时，建议使用命令行方式。在 Windows 下，用命令行开启：
C:\MYSQL>mysqld-max --standalone --console
在 Windows 下设置配置文件的原则是：
my.cnf 和 my.ini 只能是一个有效。
my.cnf 放在 C: 根目录下， my.ini 文件放在 WINDIR 目录下，C:\WINDOWS 或者 C:\WINNT。
在 Linux 下面，初始配置文件按下面的顺序搜索：
/etc/my.cnf 全局选项
COMPILATION_DATADIR/my.cnf 服务器范围的选项
defaults-extra-file 采用 --defaults-extra-file=.... 的文件
~/.my.cnf 用户指定的选项
假设你有一台 512MB 内存，三台 20GB 硬盘(路径分别为："/"，"/dr2"，"/dr3“)的服务器，设置的例子为：
[mysqld]
innodb_data_home_dir = /
innodb_data_file_path = ibdata/ibdata1:2000M;dr2/ibdata/ibdata2:2000M
set-variable = innodb_buffer_pool_size=350M
set-variable = innodb_additional_mem_pool_size=20M
innodb_log_group_home_dir = /dr3/iblogs
innodb_log_arch_dir = /dr3/iblogs
innodb_log_archive=0
set-variable = innodb_log_files_in_group=3
set-variable = innodb_log_file_size=50M
set-variable = innodb_log_buffer_size=8M
innodb_flush_log_at_trx_commit=1
set-variable = innodb_file_io_threads=4
set-variable = innodb_lock_wait_timeout=50
#innodb_flush_method=fdatasync
#innodb_fast_shutdown=1
#set-variable = innodb_thread_concurrency=5
为了提升性能，我们把日志文件和数据文件放在不同的磁盘，另外还可以采用裸的磁盘分区来存储数据以提升性能。
需要提醒的是，在 Linux x86 上不要把内存设置太高，glibc 会把进程堆增长到线程堆栈之上，能把服务器给搞垮，下面的值接近于 2GB 时就很危险：
innodb_buffer_pool_size + key_buffer +
max_connections * (sort_buffer + record_buffer) + max_connections * 2 MB
每个线程将使用 2MB(二进制版本为 256 KB) 的堆栈，在最坏的情况下，还会使用 sort_buffer + record_buffer 的附加内存。