目前用户对知识管理系统的理解，在知识管理系统的应用方面还有着很多的误区，具体有：
第一、以为知识管理和财务管理、设备管理等一样，是一个专门化的职能，只需要几个专门的人员进行管理。在这种思想指导下，企业就会选择所谓“专门的”知识管理系统，由专门的少数人来完成知识管理的工作。实际上，知识管理遍及企业业务的全过程，涉及全员的每一个人，需要全员参与。知识管理系统必须以集成应用平台为基础，孤岛式的知识管理系统是不可能完成知识管理任务的。因此，也可以说，知识管理系统的应用是典型的一把手工程。
第二、以为知识管理就是OA、文档管理系统、即时交流工具或者是一个协同商务软件。
第三、将知识管理等同于知识存储、知识挖掘工具。
第四、以为知识管理完全是软件系统的工作。实际上，知识管理作为学习型组织的一个重要工作，不是知识管理软件系统所能完全完成的，比如激励知识工作者、激励隐性知识的显性化、激励知识的分享和交流、促进学习分享和创新型企业文化的形成等等，软件系统都只是提供了辅助的便捷的工具。
第五、急功近利。知识管理系统对于企业的价值，不同于一个优秀的销售员，它并不能立即给企业带来订单。它需要日积月累才能发挥出巨大价值
明白了知识管理理解和应用的误区，其实我们也就知道了如何才是正确的选择。一个真正的知识管理系统一定是可以帮助个人和团队有效管理其隐性和显性化的知识，可以避免知识的流失，提高知识的重用和创新，