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CDK
The Chemistry Development Kit
存储BitSet到MySQL中--相似度搜索
posted @ 2011-06-29 10:20 周锐 阅读(1668) | 评论 (0)  编辑
Improved SMILES Substructure Searching-提高子结构搜索速度
posted @ 2011-06-27 21:50 周锐 阅读(937) | 评论 (0)  编辑
chemtoolkits中分子描述符计算（molecular descriptor calculator）完成      摘要: 参照Rajarshi Guha的CDKDescUI代码，已经把CDK的分子描述符计算（molecular descriptor calculator）集成到chemtoolkits中了，其中包含44个描述符。  阅读全文
posted @ 2011-04-12 22:54 周锐 阅读(1166) | 评论 (0)  编辑
使用rcdk进行化合物结构聚类处理      摘要: rcdk, 是在R下面集成了CDK工具包，以此来通过CDK生成的化学性质数据进行更深层次的统计分析，下面来看看在rcdk中如何进行多个化合物结构的聚类。  阅读全文
posted @ 2011-04-11 21:41 周锐 阅读(911) | 评论 (0)  编辑
chemtoolkits(CTK)部分功能和界面      摘要: Chemtoolkits(CTK)部分功能和界面已经完成，目前网站的主要辅助性的功能已经加入，比如新闻、文章、留言以及其他信息内容。化学信息学方面的目前只整合了里宾斯基五规则计算，以及比较流行的OSIRIS Property Explorer (LogP, 溶解度、成药可能性预测)小工具。  阅读全文
posted @ 2011-04-09 17:16 周锐 阅读(652) | 评论 (0)  编辑
CDK中根据smiles计算Fingerprinter值
posted @ 2009-10-26 22:24 周锐 阅读(702) | 评论 (0)  编辑
使用CDK生成分子结构图
posted @ 2009-10-22 08:51 周锐 阅读(752) | 评论 (0)  编辑
使用CDK进行子结构搜索
posted @ 2009-10-20 08:33 周锐 阅读(571) | 评论 (0)  编辑
使用CDK解析SDF文件
posted @ 2009-10-19 09:45 周锐 阅读(435) | 评论 (0)  编辑
使用CDK进行相似度搜索
posted @ 2009-10-19 09:37 周锐 阅读(424) | 评论 (0)  编辑
Faster Fingerprint Search with Java & CDK
posted @ 2009-10-18 14:09 周锐 阅读(489) | 评论 (0)  编辑
CDK中的相似度搜索
posted @ 2009-10-18 13:36 周锐 阅读(464) | 评论 (0)  编辑
JChemPaint (画2D化学结构的Java程序)
posted @ 2009-10-17 21:53 周锐 阅读(496) | 评论 (0)  编辑

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