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2013年10月30日

最近在公司有点时间所以深入研究了下数据库索引btree/b+tree数据结构和原理,由此牵引出了好多问题,请看如下带着问题研究。

1:为什么 btree/b+tree 数据结构适合数据库索引,它到底是怎么样一个原理和结构?

btree/b+tree 数据结构:

在之前的文章中我们介绍过AVL树,红黑树,它们都属于二叉树,即每个节点最多只能拥有2个子节点,而B-tree(B树)的每个节点可以拥有2个以上的子节点,所以我们简单概括一下:B-tree就是一颗多路平衡查找树,它广泛应用于数据库索引和文件系统中。

首先我们介绍一下一颗 m 阶B-tree的特性,那么这个 m 阶是怎么定义的呢?这里我们以一个节点能拥有的最大子节点数来表示这颗树的阶数。举个例子,如果一个节点最多有 n 个key,那么这个节点最多就会有 n+1 个子节点,这棵树就叫做 n+1(m=n+1)阶树。一颗 m 阶B-tree包括以下5条特性:

  1. 每个节点最多有 m 个子节点
  2. 除根节点和叶子节点,其它每个节点至少有 [m/2] (向上取整的意思)个子节点
  3. 若根节点不是叶子节点,则其至少有2个子节点
  4. 所有NULL节点到根节点的高度都一样
  5. 除根节点外,其它节点都包含 n 个key,其中 [m/2] -1 <= n <= m-1

这些特性可能看着不太好理解,下面我们会介绍B-tree的插入,在插入节点的过程中我们就会慢慢理解这些特性了。B-tree的插入比较简单,就是一个节点至下而上的分裂过程。下面我们具体以一颗4阶树来展示B-tree的插入过程。

首先我们 插入 200,300,400,没有什么问题,直接插入就好。

| 200 | 300 | 400 |

现在我们接着插入500,这个时候我们发现有点问题,根据定义及特性1我们知道一颗4阶B-tree的每个节点最多只能有3个key,插入500后这个节点就有4个key了。

| 200 | 300 | 400 | 500 |

这个时候我们就需要分裂,将中间的key上移到父节点,左边的作为左节点,右边的作为右节点,如下图所示:

这个时候我们是不是就明白特性3了,如果根节点不是叶子节点,那么它肯定发生了分裂,所以至少会有2个子节点。同样我们接着插入600,700,800,900插入过程如下图所示:

现在根节点也已经满了,如果我们继续插入910,920,会怎样呢?根节点就会继续分裂,树继续向上生长。看下图:

通过整个的插入过程我们也会发现,B-tree和二叉树的一个显著的区别就是,B-tree是从下往上生长,而二叉树是从上往下生长的。现在我们想想特性2和特性5是为什么?首先我们知道子节点的个数是等于key的数目+1,然后一个节点达到m个key后就会分裂,所以分裂后的节点最少能得到 m/2 - 1个key 。为啥还要减一呢?因为还要拿一个作为父节点。所以这个节点最少回拥有 m/2 - 1 + 1 = m/2 个子节点。同样得到特性5,因为最少有m/2个子节点,所以最少就含有m/2-1个key,m 阶树,每个节点存到了m个key就会分裂,所以最多就有 m-1个key。

根据以上特性我们能推出一棵含有N个总关键字数的m阶的B-tree树的最大高度h的值,

树的高度h: 1, 2, 3 , 4 ,.......... , h

节点个数s: 1, 2, 2*(m/2), 2*(m/2)(m/2), ........ ,2*(m/2)的h-2次方

s = 1 + 2(1 - (m/2)^{h-1} )/(1- (m/2))

N = 1 + s * ((m/2) - 1) = 2 * ((m/2)^{h-1} ) - 1

h = log┌m/2┐((N+1)/2 )+1

2:为什么btree/b+tree 为常用数据库索引结构?

上文说过,红黑树等数据结构也可以用来实现索引,但是文件系统及数据库系统普遍采用B-/+Tree作为索引结构,这一节将结合计算机组成原理相关知识讨论B-/+Tree作为索引的理论基础。

一般来说,索引本身也很大,不可能全部存储在内存中,因此索引往往以索引文件的形式存储的磁盘上。这样的话,索引查找过程中就要产生磁盘I/O消耗,相对于内存存取,I/O存取的消耗要高几个数量级,所以评价一个数据结构作为索引的优劣最重要的指标就是在查找过程中磁盘I/O操作次数的渐进复杂度。换句话说,索引的结构组织要尽量减少查找过程中磁盘I/O的存取次数。下面先介绍内存和磁盘存取原理,然后再结合这些原理分析B-/+Tree作为索引的效率。

主存存取原理

目前计算机使用的主存基本都是随机读写存储器(RAM),现代RAM的结构和存取原理比较复杂,这里本文抛却具体差别,抽象出一个十分简单的存取模型来说明RAM的工作原理。

图5

从抽象角度看,主存是一系列的存储单元组成的矩阵,每个存储单元存储固定大小的数据。每个存储单元有唯一的地址,现代主存的编址规则比较复杂,这里将其简化成一个二维地址:通过一个行地址和一个列地址可以唯一定位到一个存储单元。图5展示了一个4 x 4的主存模型。

主存的存取过程如下:

当系统需要读取主存时,则将地址信号放到地址总线上传给主存,主存读到地址信号后,解析信号并定位到指定存储单元,然后将此存储单元数据放到数据总线上,供其它部件读取。

写主存的过程类似,系统将要写入单元地址和数据分别放在地址总线和数据总线上,主存读取两个总线的内容,做相应的写操作。

这里可以看出,主存存取的时间仅与存取次数呈线性关系,因为不存在机械操作,两次存取的数据的“距离”不会对时间有任何影响,例如,先取A0再取A1和先取A0再取D3的时间消耗是一样的。

磁盘存取原理

上文说过,索引一般以文件形式存储在磁盘上,索引检索需要磁盘I/O操作。与主存不同,磁盘I/O存在机械运动耗费,因此磁盘I/O的时间消耗是巨大的。

图6是磁盘的整体结构示意图。

图6

一个磁盘由大小相同且同轴的圆形盘片组成,磁盘可以转动(各个磁盘必须同步转动)。在磁盘的一侧有磁头支架,磁头支架固定了一组磁头,每个磁头负责存取一个磁盘的内容。磁头不能转动,但是可以沿磁盘半径方向运动(实际是斜切向运动),每个磁头同一时刻也必须是同轴的,即从正上方向下看,所有磁头任何时候都是重叠的(不过目前已经有多磁头独立技术,可不受此限制)。

图7是磁盘结构的示意图。

图7

盘片被划分成一系列同心环,圆心是盘片中心,每个同心环叫做一个磁道,所有半径相同的磁道组成一个柱面。磁道被沿半径线划分成一个个小的段,每个段叫做一个扇区,每个扇区是磁盘的最小存储单元。为了简单起见,我们下面假设磁盘只有一个盘片和一个磁头。

当需要从磁盘读取数据时,系统会将数据逻辑地址传给磁盘,磁盘的控制电路按照寻址逻辑将逻辑地址翻译成物理地址,即确定要读的数据在哪个磁道,哪个扇区。为了读取这个扇区的数据,需要将磁头放到这个扇区上方,为了实现这一点,磁头需要移动对准相应磁道,这个过程叫做寻道,所耗费时间叫做寻道时间,然后磁盘旋转将目标扇区旋转到磁头下,这个过程耗费的时间叫做旋转时间。

局部性原理与磁盘预读

由于存储介质的特性,磁盘本身存取就比主存慢很多,再加上机械运动耗费,磁盘的存取速度往往是主存的几百分分之一,因此为了提高效率,要尽量减少磁盘I/O。为了达到这个目的,磁盘往往不是严格按需读取,而是每次都会预读,即使只需要一个字节,磁盘也会从这个位置开始,顺序向后读取一定长度的数据放入内存。这样做的理论依据是计算机科学中著名的局部性原理:

当一个数据被用到时,其附近的数据也通常会马上被使用。

程序运行期间所需要的数据通常比较集中。

由于磁盘顺序读取的效率很高(不需要寻道时间,只需很少的旋转时间),因此对于具有局部性的程序来说,预读可以提高I/O效率。

预读的长度一般为页(page)的整倍数。页是计算机管理存储器的逻辑块,硬件及操作系统往往将主存和磁盘存储区分割为连续的大小相等的块,每个存储块称为一页(在许多操作系统中,页得大小通常为4k),主存和磁盘以页为单位交换数据。当程序要读取的数据不在主存中时,会触发一个缺页异常,此时系统会向磁盘发出读盘信号,磁盘会找到数据的起始位置并向后连续读取一页或几页载入内存中,然后异常返回,程序继续运行。

B-/+Tree索引的性能分析

到这里终于可以分析B-/+Tree索引的性能了。

上文说过一般使用磁盘I/O次数评价索引结构的优劣。先从B-Tree分析,根据B-Tree的定义,可知检索一次最多需要访问h个节点。数据库系统的设计者巧妙利用了磁盘预读原理,将一个节点的大小设为等于一个页,这样每个节点只需要一次I/O就可以完全载入。为了达到这个目的,在实际实现B- Tree还需要使用如下技巧:

每次新建节点时,直接申请一个页的空间,这样就保证一个节点物理上也存储在一个页里,加之计算机存储分配都是按页对齐的,就实现了一个node只需一次I/O。

B-Tree中一次检索最多需要h-1次I/O(根节点常驻内存),渐进复杂度为O(h)=O(logdN)。一般实际应用中,出度d是非常大的数字,通常超过100,因此h非常小(通常不超过3)。

综上所述,用B-Tree作为索引结构效率是非常高的。

而红黑树这种结构,h明显要深的多。由于逻辑上很近的节点(父子)物理上可能很远,无法利用局部性,所以红黑树的I/O渐进复杂度也为O(h),效率明显比B-Tree差很多。

上文还说过,B+Tree更适合外存索引,原因和内节点出度d有关。从上面分析可以看到,d越大索引的性能越好,而出度的上限取决于节点内key和data的大小:

dmax = floor(pagesize / (keysize + datasize + pointsize))  (pagesize – dmax >= pointsize)

dmax = floor(pagesize / (keysize + datasize + pointsize)) - 1  (pagesize – dmax < pointsize)

floor表示向下取整。由于B+Tree内节点去掉了data域,因此可以拥有更大的出度,拥有更好的性能。

这一章从理论角度讨论了与索引相关的数据结构与算法问题,下一章将讨论B+Tree是如何具体实现为MySQL中索引,同时将结合MyISAM和InnDB存储引擎介绍非聚集索引和聚集索引两种不同的索引实现形式。



posted @ 2018-01-25 13:44 为自己代言 阅读(3796) | 评论 (0)编辑 收藏

同事遇到问题是一个java web 工程,依赖了一个jar包,但是jar包中也有自己一套配置文件(例spring 配置文件,资源文件等),这样如果让web工程中的war 包去加载jar 中的配置文件和资源文件呢?
我当时也有一个思想误区,以为web中加载不到jar中的文件,但是经过一番研究,终于明白了,按J2EE规范中web-inf/lib目录下是web工程的classpath 目录,容器会自动去扫描这个目录下所有的配置文件和jar加载到容器中,即:像jar中有自己一套配置文件,war 中又要依赖jar包,这样只需要把这些jar包打成war时候放到web-inf/lib下即可。
注意:1:jar包和war包中配置文件和一些资源文件不能重名。
        
         2:要在war包中的spring 配置文件中引入jar包中的配置文件。



posted @ 2015-04-24 20:42 为自己代言 阅读(6928) | 评论 (0)编辑 收藏

1、不同的tomcat的启动文件startup.sh 中要指定各自的CATALINA_HOME和CATALINA_BASE这两个环境变量。

2、不同的tomcat启动和关闭监听不同的端口

很多人喜欢把CATALINA_HOME和CATALINA_BASE配置到系统环境变量中去,我们不这么做,我们要做的只是把JDK及CLASSPATH配置到环境变量中去即可,因为这个可以通用。
CATALINA_HOME和CATALINA_BASE的区别。简单的说,CATALINA_HOME是Tomcat的安装目 录,CATALINA_BASE是Tomcat的工作目录。如果我们想要运行Tomcat的 多个实例,但是不想安装多个Tomcat软件副本。那么我们可以配置多个工作 目录,每个运行实例独占一个工作目录,但是共享同一个安装目录

下面讲具体的配置方法。

找到Tomcat的startup.sh文件,打开进行编辑。

在文件的开始位置,可以在一大堆注释的后面,加入
export CATALINA_BASE=/usr/ratest/apache-tomcat-7.0.16
export CATALINA_HOME=/usr/ratest/apache-tomcat-7.0.16

/usr/ratest/apache-tomcat-7.0.16这个就是tomcat的安装文件夹位置,不同的tomcat指定相应的文件夹即可。

注意,这两句话一定要在exec “$PRGDIR”/”$EXECUTABLE” start “$@”这句话的前面,我们放在文件的开始位置了,所以,就可以不考虑了。

然后就是要修改shutdown.sh文件,同样在头部加入上面的两行即可,也要在exec “$PRGDIR”/”$EXECUTABLE” stop “$@”的前面。

好了,解决了第一个问题,下面说第二个问题的解决方法。

找到并打开server.xml文件,里面有诸如8080,8009,8443等等端口配置,统一给这些数字加上100,或者1000或者其他什么数字,只要是不跟其他Tomcat或者当前linux上其他服务的端口重复即可。

现在进入Tomcat的bin文件夹,运行./startup.sh看看是不是可以启动多个了。

posted @ 2014-03-28 19:58 为自己代言 阅读(458) | 评论 (0)编辑 收藏

1,设置跟路径时,三种方式

在Tomcat默认安装后,tomcat的主目录是webapps/root目录,所以如果想改变tomcat的主目录的话可以如下所做,所以
第一种方法是:
打开C:/Tomcat/conf/server.xml,在<host></host>之间
加入代码:<Context docBase="d:/Tomcat 5.5/webapps/medi" path="" debug="0" reloadable="true"/>
这样重新启动tomcat,我们的主目录就被设置为dolphin这个项目了。

第二种方法是:
将tomcat安装目录下的ROOT下的所有文件全部删除,然后将工程的解压后的文件全部拷进去。

第三种方法是:
Tomcat5.0以下版本在d:/Tomcat/conf/Catalina/localhost目录下会自动生成了一个ROOT.Xml,
但是5.0以上版本不再生成此文件,所以可以新建个ROOT.xml,在里面加入如下代码:
<?Xml version='1.0' encoding='utf-8'?>
<Context crossContext="true" docBase="d:/Tomcat 5.5/webapps/medi" path="" reloadable="true">
</Context>

2,注意
此时即然配置了 默认访问目录,则不要再tomcat 部署工程了,
比如 在 conf\Catalina\localhost 增加配置文件 指定的工程路径 此文件要去掉, 否则会重复加载工程。

posted @ 2013-11-06 18:44 为自己代言 阅读(675) | 评论 (0)编辑 收藏

很多tomcat进程退出(或者进程假死),都是由于频繁的抛出OutOfMemeoryError导致的。

为了让tomcat退出前或者发生OutOfMemeoryError时自动dump堆栈信息,方便事后排查问题,我们可以做如下操作:

1、 在tomcat启动参数中加入两个参数 -XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError -XX:HeapDumpPath=/export/home/tomcat/domains/server2/oom.hprof

2、 重启tomcat

参数说明
(1)-XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError 表示当JVM发生OOM时,自动生成DUMP文件。
(2)-XX:HeapDumpPath=存储文件/目录 表示生成DUMP文件的路径

posted @ 2013-10-30 13:51 为自己代言 阅读(6198) | 评论 (2)编辑 收藏