安装方式力求简单，更多优化配置需要进一步配置。

1. 准备mysql
　　a)下载mysql-noinstall-5.1.42-win32.zip，解压到$mysql_home
　　b)到$mysql_home目录下，将my-medium.ini修改为my.ini
　　c)到$mysql_home\bin目录下，运行mysqld --console
　　d)到$mysql_home\bin目录下，执行mysql -uroot，然后执行sql：
　　create database jiradb character set utf8;
　　e)下载mysql-connector-java-5.1.11.zip，备用
2. 准备tomcat
　　a)下载apache-tomcat-6.0.20.zip，解压到$catalina_home
　　b)下载jira-jars-tomcat6.zip，解压到$catalina_home\lib目录下
　　c)把之前下载的mysql-connector-java-5.1.11.zip，解压里面的mysql-connector-java-5.1.11-bin.jar到$catalina_home\lib目录下
　　d)修改$catalina_home\conf\server.xml文件，将里面的
　　<Connector port="8080" protocol="HTTP/1.1"
               connectionTimeout="20000"
               redirectPort="8443" />
　　修改为
　　<Connector port="8080" protocol="HTTP/1.1"
               connectionTimeout="20000"
               redirectPort="8443" URIEncoding="UTF-8" />
　　e)修改$catalina_home\bin\startup.bat，在@echo off后面增加一行
set CATALINA_OPTS=%CATALINA_OPTS% -Dorg.apache.jasper.runtime.BodyContentImpl.LIMIT_BUFFER=true -Dmail.mime.decodeparameters=true -Xms128m -Xmx512m -XX:MaxPermSize=256m
　　f)启动一次，然后停止，为了在$catalina_home\conf目录下生成Catalina\localhost目录

3. 准备jira
　　a)下载atlassian-jira-enterprise-4.0.1.zip，解压到一个临时目录$jira_temp
　　b)修改$jira_temp\edit-webapp\WEB-INF\classes\entityengine.xml，将
　　<datasource name="defaultDS" field-type-name="hsql"
　　schema-name="PUBLIC"
　　修改为
　　<datasource name="defaultDS" field-type-name="mysql"
　　注意：删除了一行schema-name="PUBLIC"
　　c)修改$jira_temp\edit-webapp\WEB-INF\classes\jira-application.properties，将jira.home的值填好，jira相关的数据会放到这个目录下，比如：
　　jira.home = D:/atlassian/jira/data
　　d)下载jira_crack.rar，将WEB-INF目录解压到$jira_temp\webapp\目录下，覆盖一个目录，新增加了一个目录
　　e)运行$jira_temp\build.bat
　　f)修改$jira_temp\dist-tomcat\tomcat-6\jira.xml
　　一、修改部分如下
　　<Resource name="jdbc/JiraDS" auth="Container" type="javax.sql.DataSource"
            username="root"
            password=""
            driverClassName="com.mysql.jdbc.Driver"
            url="jdbc:mysql://localhost/jiradb?autoReconnect=true&amp;useUnicode=true&amp;characterEncoding=UTF8"
             maxActive="20"
            validationQuery="select 1"/>
　　注意，删除了两行
　　minEvictableIdleTimeMillis="4000"
　　timeBetweenEvictionRunsMillis="5000"
　　二、如果移动了atlassian-jira-4.0.1.war
　　还需要修改docBase
　　g)将jira.xml复制到$catalina_home\conf\Catalina\localhost目录下

一切就绪，启动tomcat，第一次需要等比较久一点儿。
访问http://localhost:8080/jira，如果没问题的话，正确的填写配置后，license可以填写

Description=JIRA\: COMMERCIAL
CreationDate=2010-01-20
ContactName=haha@haha.haha
jira.LicenseEdition=ENTERPRISE
ContactEMail=haha@haha.haha
Evaluation=false
jira.LicenseTypeName=COMMERCIAL
jira.active=true
licenseVersion=2
MaintenanceExpiryDate=2011-01-19
Organisation=haha
jira.NumberOfUsers=-1
ServerID=B6FW-B4KW-J1A3-4DQB
LicenseID=LID
LicenseExpiryDate=2011-01-19
PurchaseDate=2010-01-20

就可以了