解决方案
在某英文网站上找到一下答案，试了，没好用。你们可以试下OK不？
a) leave myeclipse
b) point explorer to the .metadata folder
c) right mouse button select "search" giving criteria 'org.eclipse.update*' (without quotes)
d) deleting all the files/folders found
e) restart myeclipse

通过上面的联想到其它UpdateStamp的文件，到MyEclipse的安装目录，之下的“eclipseconfigurationorg.eclipse.update”目录，
发现有一个，last.config.stamp。
a) leave myeclipse
b) delete last.config.stamp
c) restart myeclipse
之后就没有同样的窗口弹出来。
但是，如果在某项目上右键打开项目的属性窗口，点击“Myeclipse”的Update按钮，又会弹出同样的窗口。
这样的话，只要再重复一下上述操作就OK。

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