将5.0部署到myeclipse6.5+mysql5.0+Tomcat6.0上的步骤：
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step1：新建项目jpetstore5.0。建议使用JavaEE5、jdk高版本，至少要支持泛型。原因：不用它们不舒服。
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step2：
解压下载的JPetStore-5.0.zip ，复制src下的包com、properties到新建的项目jpetstore5.0的src目录下，自然，复制的是包以及包中所有的文件，不仅仅只是包名。
即然使用的是MySQL，MySQL的驱动要加载的。将mysql-connector-java-5.0.5-bin.jar复制到Tomcat6.0 的lib下，省的每次都配置。
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step3:
修改properties/database.properties文件如下：
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# Database Connectivity Properties
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driver=com.mysql.jdbc.Driver
url=jdbc:mysql://localhost:3306/jpetstore
username=root
password=root
用户名和密码是自己的MySQL配置。
src目录下应该还有ddl这个包吧，这个包里的文件是建表语句，既然使用的是MySQL那就要需要手工创建数据源database。表和导入实验数据可以使用程序自动执行（暂不介绍）。
在新建的项目jpetstore5.0的src目录下新建包ddl，拷贝解压包中src/ddl/mysql中所有的文件。
到MySQL的命令提示符下分别运行这三个文件：
mysql -uroot –p < jpetstore-mysql-schema.sql
mysql -uroot –p < jpetstore-mysql-dataload.sql
mysql -uroot –p < jpetstore-mysql-create-user.sql
以上三个文件分别是创建数据库JPetStore,导入数据，分配权限。如果你安装了MySQL的管理工具，也可以在管理工具下运行这三个文件。
事实上，这个示例代码支持好几种数据源的配置方案，你若是step3不做，项目有时也是可以正常运行的，前提是你装的hsql数据库。在src.com.ibatis.jpetstore.persistence.DaoConfig中有建表语句，使用的是hsql数据库。当然如果你和我一样，想清楚jpetstore5.0的每一个细节的话，建议修改DaoConfig代码如下：
------------START-----------
static {
try {
daoManager = newDaoManager(null);
Properties props = Resources.getResourceAsProperties("properties/database.properties");
String url = props.getProperty("url");
String driver = props.getProperty("driver");
String username = props.getProperty("username");
String password = props.getProperty("password");
//如果url为MySQL的，执行MySQL的建表语句..
if (url.equals("jdbc:mysql://localhost:3306/jpetstore")) {
Class.forName(driver).newInstance();
Connection conn = DriverManager.getConnection(url, username, password);
try {
ScriptRunner runner = new ScriptRunner(conn, false, false);
runner.setErrorLogWriter(null);
runner.setLogWriter(null);
runner.runScript(Resources.getResourceAsReader("ddl/jpetstore-mysql-schema.sql"));//建表
runner.runScript(Resources.getResourceAsReader("ddl/jpetstore-mysql-dataload.sql"));//输入实验数据
runner.runScript(Resources.getResourceAsReader("ddl/jpetstore-mysql-create-user.sql"));//权限
} finally {
conn.close();
}
}
} catch (Exception e) {
throw new RuntimeException("Description. Cause: " + e, e);
}
}
----------------END-----------------
仔细研究下ddl会发现，没有建database的语句，可是程序又在使用。这个原因很简单：一个项目建好后，数据源database一般不需要改动，可是建表语句和初始化数据的语句确是要经常改动的。自然为了方便管理，建database的ddl语句也应该保存下来。
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做完上面三步，src目录下的文件就算是全了。当然有个小bug，修改item.xml文件相应的信息为：
I.ITEMID AS itemId,
LISTPRICE AS listPrice,
UNITCOST AS unitCost,
原因：1、表的字段查询结果没有使用别名。
2、多表查询，没有指定表的名字。
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step4：
复制解压包web下所有的文件到新建的项目jpetstore5.0的WebRoot下，覆盖该包下所有的文件
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step5:
删除lib下无用的jar包，如：hsqldb.jar
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把项目部署到Tomcat6.0上，运行下试试，应该可以正常运行了。
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以上这些步骤都是首次运行jpetstore5.0的步骤，随着学习的深入这几个步骤还需要细致地研究下，做得并不完善。
比如第三步，如果修改的DaoConfig正确、你在做测试时对数据库的改动没有添加到相应的ddl中，每次运行jpetstore5.0都会重新建表，你以前做的操作是不存在的。第五步，使用MyEclipse6.5可以自己配置user library。你使用了自己的lib，可以删除的jar文件自然更多。
没用的东西就没必要存在，这样也方便学习。